При ослаблении иммунитета, метаболических расстройствах и генетически обусловленных нарушениях синтеза некоторых ферментов состав кишечной микрофлоры может изменяться. Развивается дисбактериоз, сопровождающийся ростом условно-патогенной микрофлоры, исчезновением отдельных представителей нормальной микрофлоры, иногда — появлением патогенов. Содержащиеся в кишечнике микроорганизмы частично выводятся с калом; выявить их позволяет бактериологический посев кала на дисбактериоз.
